剧情讲述由云翼（关海山）率领之大旗门当年因护宋帝昺失败而归隐大漠，十五年后欲重出江湖，却因儿子云铿（陈庭威）与仇家之女冷青萍相恋而事败，翼被逼再次归隐，而云铮（刘青云）及铁中棠（石修）却受此事连累而被逐出师门。
棠与铮遭仇家追杀，棠跌下悬崖，为水灵光（麦翠娴）及其母木柔颂（马海伦）所救、棠、光相恋，却发现二人乃同父异母之兄妹。
而铮则遇上温黛黛（刘淑华），黛黛本乃大旗门之仇家司徒笑之养女，藉接近铮而打探大旗门之下落，后黛黛受铮真情感动，改邪归正。及后，棠、铮迭遭奇遇，武功大进，铮却误会棠背叛大旗门之秘密，冒死勇闯日帝月后之长春岛，惊险重重，棠更发现了自己与光之身世真相[1]。
电视剧《铁血大旗门》结局：日后终于在日后宫里审讯云翼，她揭开了面具，让云翼认她是何人；云翼认出名震天下的日后，居然是被他当年撵出大旗门的阴素，愣住了。
日后失控地兴奋，告诉云翼，她等待这一天，等待了十八年，哪怕付出走火入魔的代价也在所不惜。
她历数大旗门规的残酷无理，自己种种血泪往事；云翼终于有所悔悟，他向日后认错，并告诉她，她的儿子还活着。
当然是皆大欢喜的大团圆结局了。夜帝父子夫妻合好，铁中棠武功大进，铁血大旗门与五福联盟的冤仇化解。有情人未成眷属。